Η Μαρία-Λουίζα Βαφιαδάκη ξεκίνησε τη συνεργασία της με το Ελληνικό Παιδικό Μουσείο τον Οκτώβριο του 2003 συμμετέχοντας η ίδια ως εκπαιδευόμενη στο σεμινάριο ενηλίκων με γνωστικό αντικείμενο «Εκπαίδευση στο Μουσείο» (κύκλος Οκτωβρίου 2003 – Δεκέμβριο 2004). Το σεμινάριο περιλάμβανε 150 ώρες θεωρία και 80 ώρες πρακτική άσκηση.

Από το 2004 και μέχρι σήμερα έχει υποστηρίξει το Ελληνικό Παιδικό Μουσείο πολλαπλώς. Πιο συγκεκριμένα:

– Υποστήριξε εθελοντικά το εκπαιδευτικό πρόγραμμα «Το Ε.Π.Μ. ταξιδεύει στο νοσοκομείο» που πραγματοποίησε το Ελληνικό Παιδικό Μουσείο στο Νοσοκομείο Παίδων (2003-2007).

– Συμμετείχε στην ομάδα μελέτης του εκθέματος «Βυθός» που στεγάστηκε στο Παιδικό Μουσείο της Αθήνας τις σχολικές χρονιές 2004-2008 αναλαμβάνοντας κυρίως την εικαστική και κατασκευαστική επιμέλεια του εκθέματος και των εκπαιδευτικών κουτιών με τις προτεινόμενες εκπαιδευτικές δραστηριότητες για τις οικογένειες.

– Ανέλαβε την εικαστική και καλλιτεχνική επιμέλεια των βαλιτσών της μουσειοσκευής «Από τη θεά Δήμητρα στα δημητριακά» στις οποίες περιέχεται εκπαιδευτικό υλικό που ταξιδεύει σε σχολικές τάξεις και άλλους χώρους εντός Ελλάδας (Μαϊος – Οκτώβριος 2004).

– Συμμετείχε ως αμοιβόμενο στέλεχος του εκπαιδευτικού τμήματος του Ε.Π.Μ (ερμηνεύτρια) τη σχολική χρονιά 2004-2005 μελετώντας και εφαρμόζοντας εκπαιδευτικά προγράμματα σε σχολικές ομάδες και σε παιδιά και οικογένειες που επισκέπτονταν το Παιδικό Μουσείο της Αθήνας.

– Από τη σχολική χρονιά 2005-2006 ως και σήμερα συμμετέχει ως σταθερή εξωτερική συνεργάτης-εισηγήτρια σε θέματα τέχνης και εικαστικών στο πλαίσιο της μουσειακής εκπαίδευσης στο σεμινάριο ενηλίκων «Εκπαίδευση στο Μουσείο», καθώς και σε σεμινάρια γονέων.